در اعماق کوههای آرارات در ترکیه، سازمان سری آرکام چیزی را یافته که معتقدند کشتی نوح است. اما ماشین کورپس آمریکا، یک سازمان سرکش از پنتاگون، قصد دارد با تصاحب کشتی، به سلطه جهانی دست یابد. تنها یک عامل ویژه آرکام به نام اسپریگان مقابل آنها ایستاده است. یوو اومینائه، اسپریگان ژاپنی، با ژان-ژاک موندو، اسپریگان فرانسوی، متحد میشود تا با اعضای ماشین کورپس به رهبری سرهنگ مکدگال، پسری جهشیافته با قدرتهای روانی مرگبار، مقابله کند. اما آنها باید سریع عمل کنند و قبل از اینکه مکدگال از کشتی برای اهداف شوم خود استفاده کند، او را متوقف کنند.